hdmf_zarr package

Submodules

• hdmf_zarr.backend module
  • ROOT_NAME
  • SPEC_LOC_ATTR
  • DEFAULT_SPEC_LOC_DIR
  • SUPPORTED_ZARR_STORES
  • ZarrIO
    • ZarrIO.can_read()
    • ZarrIO.file
    • ZarrIO.path
    • ZarrIO.abspath
    • ZarrIO.synchronizer
    • ZarrIO.object_codec_class
    • ZarrIO.open()
    • ZarrIO.close()
    • ZarrIO.load_namespaces()
    • ZarrIO.write()
    • ZarrIO.export()
    • ZarrIO.get_written()
    • ZarrIO.get_builder_exists_on_disk()
    • ZarrIO.get_builder_disk_path()
    • ZarrIO.write_builder()
    • ZarrIO.write_group()
    • ZarrIO.write_attributes()
    • ZarrIO.get_zarr_paths()
    • ZarrIO.get_zarr_parent_path()
    • ZarrIO.is_zarr_file()
    • ZarrIO.resolve_ref()
    • ZarrIO.write_link()
    • ZarrIO.write_dataset()
    • ZarrIO.get_type()
    • ZarrIO.read_builder()
    • ZarrIO.get_container()
    • ZarrIO.get_builder()
• hdmf_zarr.nwb module
  • NWBZarrIO
    • NWBZarrIO.export()
• hdmf_zarr.utils module
  • ZarrIODataChunkIteratorQueue
    • ZarrIODataChunkIteratorQueue.exhaust_queue()
    • ZarrIODataChunkIteratorQueue.append()
    • ZarrIODataChunkIteratorQueue.initializer_wrapper()
    • ZarrIODataChunkIteratorQueue.function_wrapper()
  • ZarrSpecWriter
    • ZarrSpecWriter.stringify()
    • ZarrSpecWriter.write_spec()
    • ZarrSpecWriter.write_namespace()
  • ZarrSpecReader
    • ZarrSpecReader.read_spec()
    • ZarrSpecReader.read_namespace()
  • ZarrDataIO
    • ZarrDataIO.link_data
    • ZarrDataIO.io_settings
  • ZarrReference
    • ZarrReference.source
    • ZarrReference.path
    • ZarrReference.object_id
    • ZarrReference.source_object_id
• hdmf_zarr.zarr_utils module
  • ZarrDataset
    • ZarrDataset.io
    • ZarrDataset.shape
  • DatasetOfReferences
    • DatasetOfReferences.get_object()
    • DatasetOfReferences.invert()
  • BuilderResolverMixin
    • BuilderResolverMixin.get_object()
  • ContainerResolverMixin
    • ContainerResolverMixin.get_object()
  • AbstractZarrTableDataset
    • AbstractZarrTableDataset.types
    • AbstractZarrTableDataset.dtype
    • AbstractZarrTableDataset.__getitem__()
    • AbstractZarrTableDataset.resolve()
  • AbstractZarrReferenceDataset
    • AbstractZarrReferenceDataset.__getitem__()
    • AbstractZarrReferenceDataset.dtype
  • AbstractZarrRegionDataset
    • AbstractZarrRegionDataset.__getitem__()
    • AbstractZarrRegionDataset.dtype
  • ContainerZarrTableDataset
    • ContainerZarrTableDataset.get_inverse_class()
  • BuilderZarrTableDataset
    • BuilderZarrTableDataset.get_inverse_class()
  • ContainerZarrReferenceDataset
    • ContainerZarrReferenceDataset.get_inverse_class()
  • BuilderZarrReferenceDataset
    • BuilderZarrReferenceDataset.get_inverse_class()
  • ContainerZarrRegionDataset
    • ContainerZarrRegionDataset.get_inverse_class()
  • BuilderZarrRegionDataset
    • BuilderZarrRegionDataset.get_inverse_class()

Module contents